İnsanlar için tıbbi yazılım ve kansere deva

2020 yılının Şubat ayında, Lüksemburg’da, Oncompass Medicine Bilim Müdürü Dr. István Peták, AB konsorsiyumu üyeleriyle klinik uygulamada hedefe yönelik tedavi stratejisi planlamasında nasıl işbirliği yapılacağı hakkında bir görüşme yaptı. Anahtar bileşen 24,000 kurala dayalı olarak en etkili kanser ilacını seçebilen onkoloji yazılımımızdı. Realtime Oncology Treatment Calculator (Hesaplayıcı) Oncompass Medicine tarafından geliştirilen tescilli tıbbi yazılımdır.

AB fonlu proje Marie Curie Enstitüsü öncülüğünde gerçekleştiriliyor, 2012 ve 2015 yılları arasında önceki tedavi protokollerinin etkisiz olduğu hastalarda geleneksel terapiler ile 11 moleküler eşleşmeli hedefe yönelik antikanser ilaçlarının etkinliğini kıyaslamak için hassas onkoloji klinik deney organize eden ilk kurumdur. Dr. István Peták bu konuda şunları söylüyor:

“Olması yakın projemiz bir klinik deney skuamöz hücreli kanser hastalarına hedefe yönelik imünoterapi ile kombinasyon halinde hedefe yönelik bir antikanser ilacı verilecek. Karar destek yazılımımızı kullanarak, amacımız bu ilaç kombinasyonuna hangi hastaların iyi hangi hastaların kötü yanıt vereceğini öngörebilecek biyogöstergeler bulmaktır.” Tüm protein kodlayıcı genlerin nükleotid dizilimi bu konsorsiyumun diğer ana katılımcısı olan Milano Avrupa onkoloji Enstitüsü tarafından kayıt olan hastaların hepsinin tümörleri üzerinde yapıldı. Başlıca biyoenformatik analiz Leipzig Üniversitesinden uzmanlarca yapılmaktadır.

HESAPLAYICI dijital yorum ve ilaç tahsisi sağlamak suretiyle bu projenin anahtar oyuncusudur. Dr. István Peták “Biyoenformatik analizin ardından, tümör DNA mutasyon ham verilerini alıyoruz” diyor ve ekliyor:

“Hasta başına yaklaşık 160,000 varyant. Hesaplayıcımızı kullanarak, belirlenen mutasyonları sıraya koyuyor ve en iyi ihtimalle sürücü gen mutasyonu nitelendirilenleri tespit ediyoruz. Sürücü mutasyonları sağlıklı hücrelere kıyasla selektif büyüme avantajına sebep olarak tümör oluşumuna katkıda yapan genomdaki genetik alterasyonlardır– diğer mutasyonlar tümöre katkı yapmaz.

Hesaplamadan sonra, Oncompass Medicine şirketindeki araştırmacılar eşleşen ilaç kombinasyonunun belli bir hasta veya farklı bir tedavi için daha uygun olup olmayacağına karar verir. Tedavi tavsiyelerimiz deney katılımcılarını tedavi eden hekimlerle paylaşılır, onlar bu tavsiyelere istinaden tedavilere devam eder.” Marie Curie Enstitüsü ve Oncompass Medicine bir bilgi iletim işbirliği geliştiriyor, Fransız profesyoneller tarafından oluşturulan bir elektronik hasta sicili Hesaplayıcı ile otomatik iletişim için erişilebilir hale getirildi. Dr. István Peták “Bu veriler ve bilgilerin kullanımının standardizasyonuna imkân veriyor. Fransız hekimler en uygun tedavi için tavsiyelerimizi otomatik olarak alacaklar” diyor ve sözlerine devam ediyor:

“Milano Avrupa Onkoloji Enstitüsü ile işbirliğimizin içeriği oldukça benzer. İtalyan meslektaşlarımız ile onkoloji araştırma hastanelerinin dijital karar destek sistemimizi nasıl uygulayabilecekleri hakkında çalışıyoruz. Birkaç yıldır pek çok Avrupa Kanser Merkezi çok genli moleküler teşhis koyucu tetkikler yapıyor, bunlar moleküler tümör kurulu tarafından inceleniyor. Bu, düzenli onkoloji ekipleri ile aynı değil, çünkü moleküler tümör kurulu bilinmesi gereken tüm moleküler bilgiler hakkında bilgi edindiğimiz bir forum.

Moleküler biyologlar belli bir hastanın tümörünün moleküler profilini oluşturur ve profile dayalı olarak, hâlihazırda veri tabanında mevcut olan tedavilerin etkinliklerinin dijital kıyaslaması var. Son olarak, klinik onkologlar hastanın hekimi veya onkoloji ekibi için en uygun tedaviyi önerir. İtalya’daki ortaklarımız yazılımımızı bu sürece uygulamayı planlıyor.” Oncompass Medicine ABD’de de faal. Şirketimiz kısa süre önce moleküler profil tabanlı bir klinik deneye katılmaya davet edildi.

Buna ek olarak, Oncompass Medicine Boston’da büyük bir uluslararası ilaç şirketinin Ar –Ge başkanı ile moleküler eşleşmeli klinik deneyler için hasta gruplarını seçmek için en başından dijital karar desteğimizi kullanmak suretiyle geliştirilmekte olan yeni ilaçların maliyetini nasıl en uygun hale getirilebileceği hakkında yakınlarda görüşme yaptı.

Dr. István Peták durumu şöyle özetliyor: “Söz konusu ilaçlardan fayda görme ihtimali en yüksek olan belli hasta gruplarının önceden seçilmesi ilaç şirketlerinin yüz yüze geldiği riskleri ziyadesiyle azaltacaktır. Bu, kanser ilaçlarının fiyatını da düşülebilir, böyle bir durum kanser tedavisine yönelik büyük bir adım olacaktır.” Oncompass Medicine hâlihazırda Hesaplayıcıya uygulanabilecek olan diğer teşhis koyma şirketleri tarafından geliştirilen farklı gen panelleri üzerinde çalışıyor. Bilim müdürü “Uzun vadeli amacımız Realtime Oncology Treatment Calculator’ü karar destek sistemi yerine karar alma sistemi yapmaktır” diyor.